近日,中科院合肥研究院健康所谷紅倉三代納米孔測序團(tuán)隊(duì)與合肥腫瘤醫(yī)院王宏志團(tuán)隊(duì)、醫(yī)學(xué)病理中心鄧慶梅團(tuán)隊(duì)合作,在納米孔的宏基因組測序技術(shù)用于疑似感染的免疫功能低下癌癥患者病原體的準(zhǔn)確快速診斷研究中取得新進(jìn)展。該成果在線發(fā)表在國際知名期刊 Frontiers in Cellular and Infection Microbiology 上。
癌癥患者感染和感染相關(guān)死亡的風(fēng)險(xiǎn)很高,因此,及時診斷和精準(zhǔn)抗感染治療至關(guān)重要。本研究旨在評估納米孔擴(kuò)增測序技術(shù)在識別免疫功能低下的癌癥患者微生物感染方面的性能。這項(xiàng)前瞻性研究招募了 56 名疑似感染的免疫功能低下的癌癥患者,采集他們的痰液、血液等體液樣本,通過納米孔擴(kuò)增測序技術(shù)檢測潛在微生物病原體,并和傳統(tǒng)的培養(yǎng)方法結(jié)果相比較。與傳統(tǒng)培養(yǎng)方法相比,納米孔測序能夠更敏感的檢測腫瘤伴隨細(xì)菌感染(P<0.001),苛養(yǎng)菌感染(P=0.006)和合并感染(P<0.001);平均周轉(zhuǎn)時間縮短約17.5小時。
該研究表明納米孔擴(kuò)增測序作為一種快速而精確的方法,可以用于疑似感染的免疫功能低下的癌癥患者的病原體檢測,這種新穎且高靈敏度的方法將通過促進(jìn)感染的及時診斷和精確的抗感染治療來改善免疫功能低下的癌癥患者的預(yù)后。
文章鏈接:https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fcimb.2022.943859/full
圖1:兩種方法在檢測免疫功能低下癌癥患者體液樣本中病原體的性能比較
(A.按病原體類型比較這兩種方法檢測病原體的性能;B.按樣本類型比較這兩種方法檢測病原體的性能)
圖2:納米孔擴(kuò)增測序法檢測體液中大腸埃希菌和白色念珠菌的檢出限分析